Невинномысский филиал является обособленным структурным подразделением диагностического центра, расположен в г. Невинномысске, функционирует с апреля 2004 г.
Первичная медико-санитарная помощь оказывается непосредственно как в филиале, так и на 7 здравпунктах предприятий и на дому. Филиал участвует в реализации приоритетного национального проекта «Здоровье», проводя вакцинацию от вирусного гепатита В, дополнительные и углублённые медосмотры работников, занятых на работах с вредными и (или) опасными производственными факторами.
В филиале работают 28 врачей, из них 71% имеют квалификационные категории. В арсенале врачей имеются: компьютерный томограф, рентгендиагностический аппарат, видео-эндоскопическое оборудование, оборудование для функциональной диагностики в кардиологии, неврологии, лабораторные анализаторы крови и мочи, офтальмологическое, стоматологическое и другое оборудование.
В филиале с 2009г. работает дневной стационар на 10 койко-мест.
Население прикреплённых районов имеет возможность обследоваться во всех лабораториях краевого клинического диагностического центра (биохимическая, ИФА, иммунологическая, бактериологическая, гистологическая, ПЦР). Для этого в филиале организован забор биоматериала с ежедневной доставкой его в лаборатории диагностического центра собственным транспортом и выдача результатов исследований.
